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目標(biāo)區(qū)域捕獲測序技術(shù)，是根據(jù)已知特定基因組區(qū)域序列設(shè)計(jì)寡核苷酸探針，通過雜交將目標(biāo)區(qū)域捕獲富集進(jìn)行二代測序。其針對(duì)目標(biāo)區(qū)域深度測序，增加了檢查靈敏度和準(zhǔn)確性。既滿足研究需求，又降低測序成本，在科研、臨床中均備受關(guān)注。

液體處理專家貝克曼庫爾特推出Biomek 自動(dòng)化捕獲測序方案，幫助您實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化、標(biāo)準(zhǔn)化的捕獲測序。 由自動(dòng)化工作站進(jìn)行基因捕獲，可以減少手工操作時(shí)間，提高工作效率，增加結(jié)果的重復(fù)性和均一性。 Biomek工作站可實(shí)現(xiàn)從核酸提取，文庫構(gòu)建，定量混樣到捕獲的整體實(shí)驗(yàn)流程。

Figure 1. 捕獲測序文庫構(gòu)建自動(dòng)化流程

由Biomek成功自動(dòng)化的雜交捕獲試劑盒：

-   Agilent HaloPlex? Target Enrichment - Ion Torrent

-   Agilent SureSelect XT?

-   Epicentre ScriptSeq? Complete Gold Low Input

-   Illumina Nextera? Rapid Capture

-   Illumina TruSeq? Exome

-   Illumina TruSeq? Rapid Exome

-   Illumina TruSight? Cancer

-   Illumina TruSight? Tumor 15

-   Illumina TruSight? Tumor 170

-   IDT xGen? Exome Research Panel

-   NEB NEBNext Direct? Cancer HotSpot Panel

-   Roche Nimblegen SeqCap EZ? for Illumina NGS

Biomek自動(dòng)化捕獲測序數(shù)據(jù)展示

Figure 2. IDT xGen? Exome Research Panel試劑盒捕獲測序文庫制備。

上圖： 片段分析，其中主峰1和2為雜交捕獲后cfDNA目標(biāo)片段峰；

下圖：Qubit Fluorometric Quantification核酸定量結(jié)果。

Figure 3. IDT xGen?雜交捕獲試劑盒歷史手工數(shù)據(jù)vs. 

Biomek i7自動(dòng)化工作站完成數(shù)據(jù)。A. 平均中靶率，B. 重復(fù)率，C. 覆蓋度，D. GC偏移。

Biomek向?qū)杰浖僮鹘缑?/span>

在軟件操作界面上用戶可以選擇樣本數(shù)量，是否使用臺(tái)面整合的PCR儀，以及運(yùn)行工作流程的哪個(gè)部分。此外，具備臺(tái)面自動(dòng)校對(duì)功能，當(dāng)操作人員完成耗材擺放后，工作站可根據(jù)攝像頭拍攝，自動(dòng)判定耗材擺放是否正確，對(duì)錯(cuò)誤擺放位置進(jìn)行提示。避免由于人為擺放耗材錯(cuò)誤，導(dǎo)致設(shè)備碰撞或試劑、時(shí)間損失。

Figure 4. 向?qū)杰浖僮?，IDT xGen? 雜交捕獲試劑盒方法選擇界面。

Biomek自動(dòng)化捕獲測序——實(shí)踐速度與通量的飛躍

Figure 5. 完成 24/48/96個(gè)樣本的自動(dòng)化IDT xGen?雜交捕獲測序文庫制備預(yù)估耗時(shí)。