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2025年4月,廈門大學附屬第一醫(yī)院等機構的研究人員在BMC Cancer上發(fā)表文章《Unravelling NK cell subset dynamics and specific gene signatures post-ibrutinib therapy in chronic lymphocytic leukaemia via single-cell transcriptomics》,解析伊布替尼治療后慢性淋巴細胞白血病患者NK細胞亞群的動態(tài)演變及其關鍵基因特征,為優(yōu)化免疫治療策略提供依據(jù)。
研究人員對慢性淋巴細胞白血?。–hronic Lymphocytic Leukemia,CLL)患者的外周血樣本(包括初診、伊布替尼治療后完全緩解/部分緩解及Richter綜合征患者)進行了單細胞轉(zhuǎn)錄組測序,結合t-SNE/UMAP聚類分析及軌跡分析,發(fā)現(xiàn)NK細胞可劃分為CD56bright_NK、CD56dim_NK及CLL_NK三種亞群,其中CLL_NK亞群在治療后顯著增加且高表達細胞毒性基因,并通過軌跡分析證實其為其他亞群的分化前體。
隨后,研究人員進一步通過Mendelian隨機化和共定位分析篩選出12個與CLL進展相關的關鍵基因,構建了CLL_NK細胞指數(shù)(CNI),發(fā)現(xiàn)高CNI與患者腫瘤微環(huán)境中免疫細胞浸潤水平正相關,并且利用OncoPredict預測及分子對接驗證高CNI患者對伊布替尼、氟達拉濱等藥物敏感性更強。上述結果表明,CLL_NK亞群的動態(tài)演變及其基因特征可為解析伊布替尼治療機制及優(yōu)化個體化治療策略提供關鍵依據(jù)。
研究中單細胞轉(zhuǎn)錄組測序作為關鍵技術為后續(xù)復雜分析奠定了基礎,單細胞轉(zhuǎn)錄組文庫構建過程中采用了貝克曼庫爾特生命科學SPRIselect核酸片段篩選試劑盒進行cDNA片段和index PCR產(chǎn)物的純化和雙側片段篩選,去除非目標產(chǎn)物、確保文庫片段長度符合測序要求。
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參考文獻:
Liu C, Ding T, Zou R, Zhang A, Zhi Z, Wang S. Unravelling NK cell subset dynamics and specific gene signatures post-ibrutinib therapy in chronic lymphocytic leukaemia via single-cell transcriptomics. BMC Cancer. 2025 Apr 21;25(1):745. doi: 10.1186/s12885-025-14166-0.
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